微波烘干設備與傳統加熱殺菌相比。微波殺菌有很多優點：

(1）時間短且速度快。微波利用其選擇透射作用，使食品內外均勻，迅速升溫殺滅細菌。處理時間大大縮短。在強功率密度強度下甚至只要幾秒或數十秒即達滿意效果。

(2）低溫殺菌可保證食品質量。一般殺菌溫度在75~80℃處理3-5min，容易造成營養流失。微波殺菌比常規熱力殺菌在較低溫度、較短的時間內就能獲得較好的滅蟲殺菌效果，而且無外來物污染，能夠保留更多的有效成分，保持原有的色香、味等。

(3）殺菌徹底。常規熱力殺菌是從物料表面開始，通過熱傳導，由表及里漸次加熱，內外存在溫差梯度，造成內外殺菌效果不一致，愈厚問題就愈突出。而微波的穿透性使表面與內部同時受熱，并且熱效應和非熱效應共同作用，殺菌效果好。

(4）效率高，節約能源，操控方便。微波可直接使食品內部介質分子產生熱效應，微波能可被屏蔽，而且裝置本身不被加熱，不需傳熱介質，因此，能量損失少，效率比其他方法高。微波殺菌比傳統熱力殺菌具有明顯的技術優勢，但微波加熱的不均勻性仍然是不可忽視的技術缺陷。其原因是：

①食品物料通常含有多種成分，微波的選擇性加熱會使食品不同部位的溫度上升產生差異，導致加熱的不均勻性；

②微波加熱時，其穿透、吸收、反射、折射會相互影響，會使被加熱物體的不同部分產生較大的熱能差異；

③微波電場的棱角效應也是導致加熱不均的主要原因之一。